La dispersión de datos, la heterogeneidad de instrumentos para su recopilación y la ausencia de integración e interoperabilidad entre sistemas existentes en la Universidad de Moa dificulta la evaluación de la actividad científica. El presente trabajo propone un modelo ontológico para la representación de indicadores científicos en el sistema CRIS de la Universidad de Moa, con el fin de optimizar la evaluación de la actividad investigativa institucional. La investigación se desarrolla en dos fases: diagnóstico de indicadores de evaluación científica y entidades del sistema, y el diseño de la ontología con herramientas especializadas para su desarrollo. La ontología se obtiene a partir del mapeo de esquemas de datos existentes. El modelado de indicadores científicos en lenguaje de ontología web permite el control terminológico, la representación formal de datos y el uso de razonamiento semántico para generar informes automatizados.