El tizón temprano, enfermedad producida por Alternaria solani constituye uno de los principales problemas fitosanitarios que afecta al cultivo de la papa (Solanum tuberosum L.) y el tomate (Solanum lycopersicum L.). La creciente demanda de agroquímicos ambientalmente seguros para el control de este patógeno ha incentivado el desarrollo de estrategias alternativas de control, entre las cuales se encuentra el uso de extractos de plantas. En trabajos previos se ha demostrado que Citrus latifolia presenta actividad antifúngica frente a A. solani. El objetivo de este trabajo fue determinar el daño a la morfología de la hifa de A. solani por el extracto crudo de hojas de C. latifolia y caracterizar los metabolitos activos. Los extractos de las hojas de C. latifolia se obtuvieron mediante extracción asistida por ultrasonido, se determinó el efecto del extracto sobre la hifa por microscopía electrónica y se realizó el fraccionamiento biodirigido del extracto mediante procesos de separación cromatográfica, y como bioensayo se empleó la determinación de la concentración mínima inhibitoria del extracto por microdilución en agar. Los metabolitos aislados fueron caracterizados por cromatografía de gases-espectroscopía de masas y Cromatografía líquida-espectroscopía de masas. Se demostró que el extracto provoca daños a la morfología de la hifa y se identificaron varios compuestos químicos, mayoritariamente derivados de ácidos carboxílicos, terpenos, benzopiranos y amidas, lo que sugiere que la actividad antifúngica frente a A. solani del extracto de hojas de C. latifolia se debe a la acción conjunta de estos metabolitos.