SOBERANA®02 es una vacuna conjugada eficaz contra el COVID-19 basada en la conjugación química del Receptor Binding Domain (RBD) del virus SARS-CoV-2 y el preparado de toxoide tetánico inactivado. El conjugado se digirió junto con LEP y tripsina usando el protocolo de digestión MED-FASP. La mitad de la mezcla de péptidos se analizó directamente mediante LC-MS/MS y la otra se purificó mediante cromatografía de afinidad Ni-NTA antes del análisis LC-MS/MS, y el eluato resultante se enriqueció en péptidos de tipo 2 que contenían el extremo C-terminal del péptido del RBD (⁵³⁸CNVF⁵⁴¹-HHHHHH) conjugado a residuos de lisina en péptidos trípticos derivados principalmente de la neurotoxina de C. tetanis. El RBD del SARS-CoV-2, así como 385 proteínas del toxoide tetánico, se identificaron coincidentemente con un FDR ≥ 1 % mediante tres softwares: MASCOT, Peaks y Maxquant. Entre las proteínas derivadas de C. tetanis, la neurotoxina inactivada fue la proteína más abundante representando el 30-60 % del total de proteínas según los resultados proporcionados por los métodos de estimación de abundancia de proteínas 3-top, TPA e iBAQ. Se asignaron quince sitios de conjugación entre la neurotoxina y el RBD recombinante del SARS-CoV-2 según los espectros de MS/MS.