El presente artículo describe la aplicación de una herramienta para la auditoria de la gestión de riesgos con enfoque de sostenibilidad en un destino turístico cubano. Para dar cumplimiento a este objetivo se realiza un análisis de la bibliografía disponible que aborda temas como sostenibilidad, destino turístico, auditorías y gestión de riesgos. El procedimiento aplicado parte de considerar la auditoria de riesgos desde la planeación estratégica del destino turístico y la gestión por procesos como herramientas para la gestión de las organizaciones que componen a este. Incluye un conjunto de indicadores económicos, sociales y ambientales para evaluar la gestión de los riesgos en el destino, así como un indicador integral con una estructura multicriterio del cual no existen precedentes en la literatura científica consultada y se propone como determinar el nivel de madurez del sistema de control interno. La herramienta contribuye a evaluar el sistema de control interno del destino con un enfoque estratégico. Con la aplicación del procedimiento se logra precisar los riesgos asociados, y la evaluación del índice de gestión de estos, para mejorar la sostenibilidad a partir de la implementación de acciones de mejora que se derivan de los problemas detectados.