Las emisiones de las fuentes móviles y fijas producidas por la quema de combustible fósil, son los máximos responsables del deterioro de la calidad del aire dentro de las ciudades. Se realizó el análisis de la contaminación atmosférica de las ciudades de Cienfuegos y Santa Clara a partir del inventario de fuentes fijas de contaminación de ambas ciudades y la modelación de la dispersión de los contaminantes tomando como año base el 2017. Teniendo en cuenta el desarrollo de la agricultura urbana y la ubicación de sus áreas, el trabajo tiene como objetivo, contribuir a mejorar la calidad ecotoxicológica de la producción agrícola de hortalizas y vegetales en zonas urbanas de estas ciudades, mediante una propuesta de gestión ambiental. Se obtiene el diagnóstico ambiental y mapificación  de riesgos ecotoxicológicos con un aporte de  57% y 44% de áreas agrícolas urbanas respectivamente, ubicados cerca de las vías de mayor flujo automotriz y fuentes fijas principales, en zonas con elevada carga de contaminantes a la atmósfera, para una categoría de calidad del aire de ¨Mala¨. Se proponen acciones y estudios de eficiencia energética, aplicación de pronósticos de calidad del aire, buenas prácticas operacionales, otros de tipo tecnológico, ambientales y agrícolas, que permiten mitigar el posible impacto ambiental de dichos contaminantes y así elevar la calidad de vida de la población consumidora de estos productos, con una inocuidad favorable por debajo del límite máximo permisible, de acuerdo a normas cubanas y Codex internacionales de alimentación.