En el presente estudio se examinó la microbiota intestinal de tres grupos de camarones alimentados con la cepa de Streptomyces sp. RL8 (RL8), una mezcla de Lactobacillus graminis y Streptomyces sp. RL8 y N7 (Lac-Strep) así como una mezcla de Bacillus spp. y Streptomyces sp. RL8 y N7 (Bac-Strep). El análisis se realizó mediante la secuenciación de la región V4-V5 del gen ARNr 16S de los animales tratados y un grupo control, antes y después del reto con Vibrio parahaemolyticus. Los grupos RL8 y Bac-Strep mostraron los índices de diversidad Shannon más elevados, con valores después del reto de 3.94±0.11 y 3.39±0.3 respectivamente, en comparación con el grupo de control de 2.58±0.26. Los phylum más abundantes fueron Proteobacteria, Actinobacteria y Bacteroidetes antes y después de la infección. El análisis de componentes principales y STAMP mostraron que la composición de la microbiota de los grupos RL8 y Bac-Strep después del reto fue más uniforme que en los demás grupos experimentales, y se caracterizó por una estimulación significativa de la población de Bacteriovorax y de varios géneros productores de agentes antimicrobianos, los cuales protegen a los camarones de la infección.