Simposio “Transferencia de Conocimiento en Tecnologías de la Información”

Application of hierarchical cluster techniques in the taxonomic analysis of plant germplasm

Nowadays, there is a limited knowledge of different analysis types, techniques and statistical tools in the numerical taxonomy, available for a more reliable processing in the genotype classification. To solve this problem partially, a study was conducted on four combinatorial data strategies, distance measures, agglomeration and validation methods to determine those clusters that best fit the characteristics of cocoyam (Xanthosoma spp.) germplasm. Functions implemented on the basis of the R programming language were used for the analyses. A detailed knowledge of unsupervised hierarchical clustering methods, which best influence the classification results of cocoyam germplasm individually and in its combination is available for the first time. In addition to, the strength of the combination of statistical techniques used in the conformation of consistent structures, as well as in the validation of these ones was shown. Because of its flexibility, this analysis can be applied to other classification studies in plant germplasm banks.

En la taxonomía numérica existe actualmente un conocimiento limitado de los diferentes tipos de análisis, técnicas y herramientas estadísticas que se disponen para un procesamiento más confiable en la clasificación de genotipos. Para solucionar en parte esta problemática se realizó un estudio sobre cuatro estrategias combinatorias de datos, medidas de distancias, métodos de aglomeración y validación, para determinar aquellos conglomerados que se ajustan mejor a las características del germoplasma de malanga (Xanthosoma spp.). Para los análisis se utilizaron funciones implementadas sobre la base del lenguaje de programación R. Se dispone por primera vez de un conocimiento detallado de los métodos de agrupamientos jerárquicos no supervisados, que influyen mejor en los resultados de la clasificación del germoplasma de malanga, de forma individual y en su combinación. Además, se demostró la fortaleza de la combinación de las técnicas estadísticas empleadas en la conformación de estructuras consistentes, así como, en la validación de estas. Por su flexibilidad, este análisis puede ser aplicado a otros estudios de clasificación en bancos de germoplasma vegetal.