Los estudios científicos sobre transexualidad nacieron con la medicina y después se involucraron otras perspectivas sociales que han facilitado su identificación como realidad compleja. El atravesamiento del poder en la construcción social de la sexualidad aporta ideas claves para los estudios sobre transexualidad. La presente investigación ofrece un recorrido teórico-metodológico sobre ello en el conocimiento científico; proponiendo la conceptualización: contradicción deseo-poder. Con visión materialista-dialéctico, parte del objeto de estudio y utiliza un enfoque mixto; en consecuencia, la aplicación de este método hace que se plantee un estudio analítico propositivo. Es resultado que las mujeres trans no conocen la contradicción deseo-poder, ello hace que sean sometidas social y sexualmente. Entre las principales conclusiones se encuentra el vacío teórico existente sobre la contradicción deseo-poder; no son conscientes de la reproducción del modelo binario como parte del juego de poder que responde a posiciones ideológicas dominantes; por ello se constata que no existe conciencia crítica sobre el tema; se propone un sistema de acciones educativas, instructivo en temas relacionados con la sexualidad y las diferentes expresiones de la diversidad sexual. El análisis del enfoque de género resultó esencial, gracias al derrumbe de la concepción heredada en filosofía, y al auge de los estudios sociales de ciencia, tecnología y sociedad en el que la categoría género alcanza un enfoque plural y diversificado.