Estudios toxicológicos y epidemiológicos ponen de manifiesto que el PM2,5 tiene efectos negativos significativos en la salud humana, asociado con mortalidad, insuficiencia cardíaca, trastornos respiratorios, enfermedades pulmonares y cáncer. La toxicidad y el efecto inflamatorio de estas partículas están relacionado con su tamaño y características químicas. El objetivo de este estudio fue determinar las características químicas de las fracciones acuosolubles del material particulado PM2,5 recolectado en tres puntos de monitoreo del área urbana de la ciudad de Cuenca-Ecuador y evaluar su actividad genotóxica en la línea celular de Hámster Chino CHO-K1. El análisis gravimétrico de las muestras reveló que dos de los sitios de estudio superaron el límite de 25 µg/m3 establecido por la OMS. En la caracterización de las fracciones acuosa se determinó la presencia de metales como el Fe y Zn. Las células fueron expuestas a 1,63 m3/mL del extracto acuoso para evaluar el posible efecto genotóxico mediante el ensayo del cometa. Finalmente se observó que los extractos acuosos de PM2,5 inducen daño genotóxico en dos sitios de estudio, los principales efectos asociados a este tipo de daño pueden atribuirse a la combinación de las especies químicas detectadas. Los resultados indican que los elementos asociados al PM2,5 del extracto acuoso podría causar efectos adversos en la salud de la población ya que ocasionó efectos genotóxicos en la línea celular de Hámster Chino CHO-K1